En 2021 compite en la Primera División, camiseta ecuador mundial 2022 donde consiguió avanzar hasta los cuartos de final de la Zona Campeonato. En 2019, Independiente finaliza el campeonato penúltimo en zona de Play Out, donde tuvo que enfrentarse con Villa La Ñata. También tiene un equipo reserva de la Primera División en el que participa anualmente en el Torneo de Reserva. Independiente es uno de los clubes fundacionales de la Primera División de futsal argentino y actualmente compite en la categoría.
